More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0740 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0740  putative integrase  100 
 
 		 171 aa  357  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.650968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3692  integrase family protein  38.04 
 
 		 412 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  33.75 
 
 		 325 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7595  integrase family protein  33.56 
 
 		 413 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  34.59 
 
 		 409 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0711  phage integrase  30.07 
 
 		 414 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.209263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0243  integrase family protein  32.48 
 
 		 408 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  27.54 
 
 		 405 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4387  integrase family protein  32.9 
 
 		 432 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.864459  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4357  integrase family protein  32.9 
 
 		 432 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.196214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2984  integrase family protein  32.9 
 
 		 432 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.443483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1215  integrase family protein  32.9 
 
 		 432 aa  91.7  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  27.95 
 
 		 405 aa  90.9  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0835  site-specific recombinase, phage integrase family  31.37 
 
 		 414 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.916453  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0507  site-specific recombinase, phage integrase family  31.37 
 
 		 414 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2397  site-specific recombinase, phage integrase family  31.37 
 
 		 414 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0669  integrase family protein  31.37 
 
 		 414 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0326  integrase family protein  31.37 
 
 		 414 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.061717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  31.06 
 
 		 395 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  29.19 
 
 		 304 aa  87.8  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0372  integrase family protein  30.87 
 
 		 411 aa  84.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4899  integrase family protein  26.71 
 
 		 419 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2243  integrase family protein  28.1 
 
 		 634 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308356 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  27.63 
 
 		 418 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4018  phage integrase family protein  30.43 
 
 		 409 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0438  phage integrase  32.89 
 
 		 515 aa  77.4  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6461  phage integrase family protein  28.3 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0777  integrase family protein  26.42 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000241017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2214  integrase domain protein SAM domain protein  28.39 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000184093 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  32.21 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  27.5 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  28.48 
 
 		 400 aa  71.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  28.48 
 
 		 400 aa  71.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  28.48 
 
 		 400 aa  71.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  28.48 
 
 		 400 aa  71.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  28.03 
 
 		 403 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  28.03 
 
 		 403 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  28.03 
 
 		 403 aa  70.9  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0770  integrase family protein  27.22 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000130395 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3264  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.860131  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1271  phage integrase  29.17 
 
 		 410 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896321  normal  0.0119714 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 403 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 364 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  26 
 
 		 325 aa  67  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4004  integrase family protein  26.8 
 
 		 508 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1436  integrase family protein  23.75 
 
 		 641 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  26.35 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3698  integrase family protein  26.8 
 
 		 508 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.73 
 
 		 317 aa  64.3  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 309 aa  64.3  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.93 
 
 		 284 aa  64.3  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  25 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  25 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  25 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  25 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.46 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  26.32 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  26.32 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  26.8 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  26 
 
 		 336 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  25.49 
 
 		 304 aa  61.2  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  29.73 
 
 		 290 aa  60.8  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 308 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 330 aa  60.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  27.88 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.03 
 
 		 369 aa  60.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.03 
 
 		 369 aa  60.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  28.93 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  28.1 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  22.73 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  25.83 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.35 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.94 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  25.66 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.35 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  35.23 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.15 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  35.23 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  31.9 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  31.58 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  28.57 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  35.23 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  31.58 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>