More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1739 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1739  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 541 aa  1087    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3680  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.87 
 
 		 537 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0804  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.54 
 
 		 540 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.271201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1949  GMC family oxidoreductase  42.67 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0586145  unclonable  0.000000512241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.51 
 
 		 534 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.92 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  41.58 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4278  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.25 
 
 		 546 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.2 
 
 		 533 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2644  choline dehydrogenase  40 
 
 		 574 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3131  normal  0.995844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1348  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.25 
 
 		 555 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3358  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.15 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.76 
 
 		 539 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.59 
 
 		 551 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1169  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.37 
 
 		 544 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.67 
 
 		 551 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3734  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.33 
 
 		 539 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569573  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6414  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.93 
 
 		 569 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2869  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.96 
 
 		 531 aa  365  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6126  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.93 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0698  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.77 
 
 		 551 aa  365  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763915  decreased coverage  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3754  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.83 
 
 		 552 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6221  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.14 
 
 		 551 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.768834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4519  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.44 
 
 		 542 aa  363  5.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.94 
 
 		 546 aa  363  6e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  41.37 
 
 		 557 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1712  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.89 
 
 		 536 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1993  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.59 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.689295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4528  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.37 
 
 		 550 aa  360  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3245  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.44 
 
 		 541 aa  359  8e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  40 
 
 		 1290 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0016  GMC family oxidoreductase  40.73 
 
 		 571 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.67 
 
 		 531 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3345  putative choline dehydrogenase lipoprotein oxidoreductase  40.92 
 
 		 544 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4282  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.51 
 
 		 541 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0936618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.03 
 
 		 518 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3916  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.93 
 
 		 570 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.09 
 
 		 561 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3292  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.3 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3836  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.18 
 
 		 552 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4024  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.3 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.96 
 
 		 548 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.010293  normal  0.0125106 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.09 
 
 		 578 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7484  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.81 
 
 		 540 aa  355  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2973  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.09 
 
 		 578 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0084  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.79 
 
 		 561 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  39.3 
 
 		 559 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.01 
 
 		 531 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673966  normal  0.0679471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0072  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.78 
 
 		 548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000289824 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0075  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.04 
 
 		 548 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0217236  hitchhiker  0.000000000166725 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1579  GMC family oxidoreductase  38.87 
 
 		 538 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.34 
 
 		 549 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0379  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.43 
 
 		 561 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.547606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.33 
 
 		 577 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713026  normal  0.534597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3792  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.63 
 
 		 535 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4211  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.19 
 
 		 559 aa  352  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0056  GMC family oxidoreductase  40.11 
 
 		 550 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000620913 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0946  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.51 
 
 		 538 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6820  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.33 
 
 		 602 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0073  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.29 
 
 		 561 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2933  oxidoreductase, GMC family protein  41.58 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0201  oxidoreductase, GMC family protein  41.39 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3378  oxidoreductase, GMC family protein  41.58 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1610  oxidoreductase, GMC family protein  41.58 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10850  putative dehydrogenase  37.86 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000202363  normal  0.801894 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3995  GMC family oxidoreductase  41.58 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3050  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40 
 
 		 564 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2991  oxidoreductase, GMC family protein  41.58 
 
 		 561 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5947  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.11 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  40.33 
 
 		 546 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.15 
 
 		 533 aa  350  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4865  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.78 
 
 		 539 aa  349  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69396  normal  0.438414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5265  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.81 
 
 		 546 aa  349  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2838  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.98 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0082  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.59 
 
 		 578 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4069  GMC family oxidoreductase  41.03 
 
 		 561 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5650  Choline dehydrogenase  39.56 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3637  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.26 
 
 		 576 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3540  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.08 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3373  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.7 
 
 		 553 aa  347  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3611  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.88 
 
 		 534 aa  347  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3287  hypothetical protein  40.04 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5514  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.29 
 
 		 537 aa  347  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3214  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.9 
 
 		 544 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0194  GMC family oxidoreductase  40.07 
 
 		 548 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.73 
 
 		 576 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3708  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.17 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.79 
 
 		 560 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.7 
 
 		 531 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1543  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.37 
 
 		 530 aa  344  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5304  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.57 
 
 		 546 aa  344  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1397  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.85 
 
 		 532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16390  putative GMC-type oxidoreductase  39.59 
 
 		 557 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2716  putative GMC oxidoreductase  40.11 
 
 		 562 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2890  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.62 
 
 		 534 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.561362  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.39 
 
 		 531 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1213  putative alcohol dehydrogenase (acceptor)  40.18 
 
 		 534 aa  343  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5414  choline dehydrogenase, a flavoprotein  39.89 
 
 		 534 aa  343  5.999999999999999e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0332  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.19 
 
 		 544 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.84 
 
 		 547 aa  342  7e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>