173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  77.57 
 
 		 295 aa  434  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  75.19 
 
 		 273 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  75.75 
 
 		 271 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  77.69 
 
 		 276 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  72.12 
 
 		 283 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  71.38 
 
 		 283 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  69.29 
 
 		 285 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  69.78 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  68.91 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  68.91 
 
 		 289 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  71.65 
 
 		 265 aa  391  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  72.66 
 
 		 286 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  64.04 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  64.18 
 
 		 273 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  60 
 
 		 285 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  50.18 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  41.02 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  36.9 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  39.5 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  36.44 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  35.22 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  31.12 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  30.56 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  37.36 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  31.36 
 
 		 325 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.56 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  35.19 
 
 		 599 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  30.45 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  31.6 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  29.76 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  34.69 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30.08 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.97 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  31.11 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  32.46 
 
 		 298 aa  92  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  30.66 
 
 		 321 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  29.86 
 
 		 320 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  28.72 
 
 		 321 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  29.86 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  32.47 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  30.94 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  30.12 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  30.66 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33.96 
 
 		 269 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  32.56 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.6 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  31.23 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  30 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  28.62 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.04 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  28.25 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  34.82 
 
 		 590 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  29.26 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  29.58 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  26.79 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  31.4 
 
 		 294 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  28.67 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  26.45 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  32.34 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  27.05 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  28.52 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  26.69 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.94 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.94 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.33 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  32.05 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  27.34 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  30.95 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.63 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.87 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.44 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  27.39 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.93 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.23 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.75 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.25 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  28.17 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.14 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  27.19 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.55 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.73 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.61 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.98 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.33 
 
 		 235 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.85 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.07 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.71 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1229  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  31.03 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000422585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  28.31 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.96 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.85 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.85 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.85 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.85 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.85 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.85 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.43 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>