More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1930 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1825  riboflavin synthase, alpha subunit  57.14 
 
 		 202 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1231  riboflavin synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 203 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000560393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1353  riboflavin synthase subunit alpha  52.22 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0512  riboflavin synthase subunit alpha  51.23 
 
 		 203 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00148394  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0712  riboflavin synthase subunit alpha  50.73 
 
 		 204 aa  223  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1445  riboflavin synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 207 aa  221  7e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.575179  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0555  riboflavin synthase subunit alpha  51.47 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.560873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1099  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.680954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1908  riboflavin synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000158987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  36.5 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  36.5 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  39.57 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.21 
 
 		 217 aa  154  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  40.72 
 
 		 213 aa  151  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  37.62 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  38.38 
 
 		 220 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 219 aa  147  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  38.16 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  39.42 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  39.49 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.21 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 199 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  35.58 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  40.1 
 
 		 216 aa  143  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 218 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  38.27 
 
 		 218 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  37 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  36.36 
 
 		 217 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  38.38 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  42.05 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  34.27 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.19 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  36.74 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.71 
 
 		 215 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  36.36 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 223 aa  140  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  36.71 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  33.67 
 
 		 199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  35.55 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  34.91 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.55 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 207 aa  138  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  38.02 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  36.89 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  35.71 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  36.87 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  36.59 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  35.78 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>