253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1541 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  100 
 
 		 324 aa  662    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  38.46 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  37.81 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  36.07 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  35.62 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.12 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  32.52 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  32.48 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  33.22 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  34.48 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  32.14 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  29.18 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  25.99 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.21 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  31.73 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 345 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  27.69 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 360 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  29.03 
 
 		 369 aa  143  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  28.22 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  27.6 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  26.97 
 
 		 369 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  25 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  24.48 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  26.45 
 
 		 354 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  24.76 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25 
 
 		 382 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  22.82 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.89 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.14 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.79 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  25.96 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  22.73 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.9 
 
 		 362 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.8 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.85 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 682 aa  70.1  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  26.47 
 
 		 682 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  24.48 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.84 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0443  hypothetical protein  50.85 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  23.3 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  21.35 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4113  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.13 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.18 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  22.46 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  20.62 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.07 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4449  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.45 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4488  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.66 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4265  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.36 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4102  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.36 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4597  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  26.36 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3000  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.796809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4450  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.03 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4502  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.03 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.04 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  23.21 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0748  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.13 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  24.91 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  22.15 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.42 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23.21 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>