271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3027 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3027  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.689571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3253  hypothetical protein  90.69 
 
 		 325 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584658  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2494  hypothetical protein  63.64 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  59.87 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2454  hypothetical protein  57.33 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2499  hypothetical protein  57.33 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2491  hypothetical protein  57.33 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0213363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  56.11 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  53 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  52.87 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1385  hypothetical protein  53.33 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  hitchhiker  0.0076761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  50.16 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2750  hypothetical protein  58 
 
 		 302 aa  275  9e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3660  hypothetical protein  55.35 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  55.17 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5130  hypothetical protein  54.52 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355874  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2146  protein of unknown function DUF58  58.75 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1246  hypothetical protein  52.13 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.537762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1796  hypothetical protein  53.9 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  51.23 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1677  hypothetical protein  49.69 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.929905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1136  hypothetical protein  51.22 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231211  hitchhiker  0.0000385837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2378  hypothetical protein  49.84 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000849486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1953  protein of unknown function DUF58  47.62 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534202  hitchhiker  0.00411343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  42.49 
 
 		 329 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  44.26 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  36.94 
 
 		 340 aa  185  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  42.42 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  41.36 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  41.23 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  37.41 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  37 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  39.18 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  30.14 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  36.49 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  29.73 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  31.41 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  35.02 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  27.76 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2316  hypothetical protein  37.2 
 
 		 418 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  24.32 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  32.99 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  34.63 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  27.7 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  27.08 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  25.71 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  26.71 
 
 		 287 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.45 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.06 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  27.31 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0253  hypothetical protein  31.72 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.153051 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  24.66 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  28.52 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  27.34 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  29.97 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1125  hypothetical protein  28.83 
 
 		 286 aa  106  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  25.71 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2989  hypothetical protein  26.07 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  23.96 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  26.24 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1216  hypothetical protein  30.42 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  27.37 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  31.05 
 
 		 358 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  23.75 
 
 		 287 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  24.57 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  28.9 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  29 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  27.3 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  28.09 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  28.51 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  29.31 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  31.42 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  28.09 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  24.9 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2890  hypothetical protein  30.61 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4525  hypothetical protein  31.64 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0105502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  28.27 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  29.11 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.4 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  21.83 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0654  hypothetical protein  22.18 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751946  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  26.17 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  29.57 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  29.25 
 
 		 302 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2916  hypothetical protein  28.64 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  29.06 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2397  hypothetical protein  27.36 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850774 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  30.1 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2770  hypothetical protein  28.18 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  29.21 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  31.97 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  31.97 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  32.02 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  31.97 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.24 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  28.62 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  31.56 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  27.97 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>