102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8363 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  100 
 
 
401 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  64.78 
 
 
402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  53.22 
 
 
388 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  45.83 
 
 
398 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  42.86 
 
 
399 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  41.04 
 
 
394 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  39.65 
 
 
388 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  40.25 
 
 
399 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  40.96 
 
 
402 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  36.57 
 
 
403 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  35.08 
 
 
411 aa  211  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.55 
 
 
914 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.55 
 
 
900 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.55 
 
 
900 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  29.1 
 
 
891 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.27 
 
 
407 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  29.41 
 
 
924 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  27.27 
 
 
407 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  29.25 
 
 
926 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  28.93 
 
 
904 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  28.93 
 
 
904 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  32.82 
 
 
896 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  32.82 
 
 
894 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  28.77 
 
 
912 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  30.2 
 
 
756 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  31.95 
 
 
411 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.32 
 
 
405 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.13 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.19 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.56 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  34.36 
 
 
411 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  26.2 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.84 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.84 
 
 
436 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.9 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  30.91 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  30.66 
 
 
399 aa  63.2  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.42 
 
 
541 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.99 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.35 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  25.26 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  33.8 
 
 
432 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.96 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.33 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.26 
 
 
412 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.38 
 
 
424 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  24.77 
 
 
575 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  31.58 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  26.09 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  26.09 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.74 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  26.09 
 
 
414 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.33 
 
 
723 aa  53.5  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.3 
 
 
428 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25 
 
 
398 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.57 
 
 
397 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  27.56 
 
 
373 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  28.76 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24.57 
 
 
406 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  31.79 
 
 
441 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24.32 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24.32 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.16 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  29.17 
 
 
424 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  23.95 
 
 
1033 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.91 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.91 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.41 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  36.36 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  22.26 
 
 
410 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.46 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.05 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  22.79 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.02 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  29.61 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  29.61 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  24.11 
 
 
411 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  26.4 
 
 
453 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  26.4 
 
 
453 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  29.61 
 
 
424 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  21.9 
 
 
409 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.9 
 
 
543 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  20.99 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2413  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.5 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.545734  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.03 
 
 
704 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.91 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1644  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  28.24 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.63 
 
 
726 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.39 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3513  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.57 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.697778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.36 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  34.06 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2970  D-alanine--D-alanine ligase  35.23 
 
 
361 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.12 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.41 
 
 
405 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  22.44 
 
 
414 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6903  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.92 
 
 
419 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  22.99 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.17 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.17 
 
 
422 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>