More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6563 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  27.04 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  48.33 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 218 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  36.46 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  31.54 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  29.77 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  43.84 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  43.42 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  43.42 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  27.56 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  47.17 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>