88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5241 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0229  transcriptional regulator, XRE family  54.23 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.565553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3397  XRE family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 282 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3041  XRE family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.620788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5325  XRE family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0324  XRE family transcriptional regulator  52.71 
 
 		 282 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0860  XRE family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4943  XRE family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 282 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319472  normal  0.149365 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5211  XRE family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 282 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0654852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4683  XRE family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4547  transcriptional regulator, XRE family  52.76 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  51.57 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  55.28 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  52.59 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  50.97 
 
 		 264 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5020  transcriptional regulator, XRE family  52.21 
 
 		 275 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0224601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0588  XRE family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4390  transcriptional regulator, XRE family  53.08 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1232  XRE family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 261 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2755  XRE family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111359  normal  0.347347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0770  transcriptional regulator, XRE family  48.82 
 
 		 262 aa  228  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.528769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  50.61 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 267 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  53.82 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 285 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3594  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.328553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6073  XRE family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3014  XRE family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436062  normal  0.451981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3292  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.028295  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0736  transcriptional regulator, XRE family  43.58 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5585  transcriptional regulator, XRE family  44.14 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  44.4 
 
 		 278 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5749  XRE family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2451  helix-turn-helix domain protein  43.03 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8678  transcriptional regulator, XRE family  41.73 
 
 		 288 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.947693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0085  putative transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1833  transcriptional regulator, XRE family  47.15 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  0.015982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2234  transcriptional regulator, XRE family  40.23 
 
 		 281 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3526  XRE family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.565274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2339  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1100  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6350  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4760  putative transcriptional regulator  39.48 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.194749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4636  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4574  transcriptional regulator, XRE family  38.34 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0349  XRE family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0919  XRE family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601678 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4027  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4631  transcriptional regulator, XRE family  38.91 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2653  Cro/CI family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3152  XRE family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0104  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2160  XRE family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3344  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3497  XRE family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0311  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.679895  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0310  XRE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 211 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 96 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 295 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 106 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 105 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2269  helix-turn-helix domain-containing protein  52.5 
 
 		 48 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  32.39 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3439  transcriptional regulator, XRE family  32.59 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  25.6 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  25.6 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  27 
 
 		 101 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  25.6 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40 
 
 		 508 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  35.48 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  38.18 
 
 		 181 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  38.18 
 
 		 181 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 513 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>