27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69049 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  100 
 
 		 150 aa  300  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02996  Multiprotein-bridging factor 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y4]  51.59 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.698454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00750  MBF1, putative  48.73 
 
 		 150 aa  115  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14374  predicted protein  51.96 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123267  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8975  predicted protein  54.32 
 
 		 88 aa  88.6  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1287  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 268 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  27.64 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 223 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  36.51 
 
 		 223 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2129  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 264 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.862241  normal  0.041856 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1662  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 242 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.126051  hitchhiker  0.00273483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3356  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0589  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 315 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  38 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5469  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 271 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 237 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>