73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1419 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 178 aa  349  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  44.65 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  42.5 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  41.25 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  31.64 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  33.53 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  30.41 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  34.73 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  35.15 
 
 		 163 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 134 aa  72  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  29.24 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  28.31 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  24 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  42.86 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  35.71 
 
 		 347 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 93 aa  45.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 106 aa  44.7  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 513 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  24.28 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  31.71 
 
 		 348 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 88 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 90 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 89 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 93 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 91 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 270 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 		 279 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 93 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 95 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02996  Multiprotein-bridging factor 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8Y4]  40.38 
 
 		 154 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.698454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 446 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  39.06 
 
 		 67 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2219  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 146 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 169 aa  42  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.48 
 
 		 517 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 414 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 83 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  33.85 
 
 		 72 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 370 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 99 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 95 aa  40.8  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 76 aa  41.2  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4773  transcriptional regulator, XRE family  28.74 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0282623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>