29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0459 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  326  8e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 172 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  40.37 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  37.95 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  36.26 
 
 		 177 aa  98.2  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  38.75 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  39.51 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  38.69 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  34.59 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 		 181 aa  91.7  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 159 aa  91.3  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  35.33 
 
 		 173 aa  87  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  38.22 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  34.66 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 183 aa  84  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  32.57 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  45.56 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  36 
 
 		 296 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 166 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>