31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1037 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  53.22 
 
 		 170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  54.49 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  43.37 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  36.7 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  37.36 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  37.08 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  35.37 
 
 		 159 aa  88.2  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  34.16 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  28.18 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  30.72 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  29.01 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 446 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.7 
 
 		 517 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0026  hypothetical protein  31.75 
 
 		 647 aa  40.8  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>