135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1032 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  328  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 		 159 aa  173  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  44.65 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 173 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 170 aa  98.2  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  36.75 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  34.66 
 
 		 177 aa  94.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  38.41 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  32.6 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  31.52 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  25.31 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 325 aa  53.9  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  26.38 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 		 255 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 208 aa  47.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  37.04 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 184 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  36.23 
 
 		 395 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 203 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1572  transcriptional regulator, XRE family  21.64 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 189 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 209 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  29.33 
 
 		 218 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 256 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  33.96 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  48.48 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  32.73 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  32.26 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 184 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 89 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 194 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  28.85 
 
 		 196 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.91 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  34.55 
 
 		 387 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 67 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.24 
 
 		 203 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  35.48 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>