59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2372 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 173 aa  343  8e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  68.33 
 
 		 181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  62.09 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  64.25 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  63.39 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  38.37 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  37.28 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  30.81 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  37.06 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  34.5 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  33.53 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  28.09 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  28.07 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  25.15 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  34.94 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 67 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 67 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 67 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  33.9 
 
 		 67 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  37.04 
 
 		 367 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14374  predicted protein  27 
 
 		 104 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123267  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69049  predicted protein  36.54 
 
 		 150 aa  42  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 802 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  37.04 
 
 		 367 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 112 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 435 aa  41.2  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  43.18 
 
 		 347 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  47.83 
 
 		 332 aa  40.8  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  43.18 
 
 		 348 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  38.71 
 
 		 244 aa  40.8  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>