63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2145 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  316  9e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  63.35 
 
 		 161 aa  206  9e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  67.7 
 
 		 160 aa  204  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  63.41 
 
 		 161 aa  200  7e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  44.13 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  33.54 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  42.03 
 
 		 134 aa  95.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  36.42 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  29.19 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  37.06 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  29.09 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  25.58 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  35.79 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  26.34 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 133 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 371 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  38.81 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2926  Fis family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  normal  0.125952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  34.21 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2878  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4705  helix-turn-helix domain-containing protein  43.4 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  29.11 
 
 		 359 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 99 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2064  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  32.43 
 
 		 299 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  42.31 
 
 		 101 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3773  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 76 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 300 aa  41.2  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 219 aa  41.2  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3779  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 270 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4070  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00101139  hitchhiker  0.00129674 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 256 aa  41.2  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 259 aa  40.8  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0498  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 84 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000229661  normal  0.0571144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3774  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0502189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2388  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  40.8  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 123 aa  40.8  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2112  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  31.08 
 
 		 299 aa  40.8  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 279 aa  40.8  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>