31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0498 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0498  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  164  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000229661  normal  0.0571144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0488  transcriptional regulator, XRE family  85.71 
 
 		 84 aa  142  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  47.17 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  50.98 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 114 aa  43.9  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  45.1 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  45.59 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  50.98 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 252 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 68 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  39.68 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  49.18 
 
 		 403 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 71 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  46.15 
 
 		 367 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>