36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0488 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0488  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.592265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0498  XRE family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 84 aa  142  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000229661  normal  0.0571144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  45.61 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  44.64 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  50.88 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4356  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.623586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  44.23 
 
 		 73 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 180 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  44.64 
 
 		 368 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  43.4 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 203 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 72 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  43.48 
 
 		 264 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  46.03 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 380 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 314 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5476  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 761 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  41.07 
 
 		 436 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>