30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0938 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  55.56 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  34.5 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  36.75 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  33.99 
 
 		 182 aa  87.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  33.74 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  31.74 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 366 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 166 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>