21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2081 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1157  DNA binding domain-containing protein  58.62 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0872862  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  55.62 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1572  transcriptional regulator, XRE family  48.4 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  24.68 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  30.92 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  29.14 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  28.1 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  28.86 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  25.98 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  24.36 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  27.13 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  29.53 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>