59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1247 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 165 aa  332  1e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  37.11 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  34.32 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  31.3 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  28.22 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  27.71 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  25.15 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  23.2 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  37.74 
 
 		 272 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 806 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 68 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  24.03 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  42.31 
 
 		 327 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2926  Fis family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  normal  0.125952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  38.24 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2940  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  33.77 
 
 		 109 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  44.9 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1779  hypothetical protein  30.93 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  33.87 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 79 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 111 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 221 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 300 aa  41.6  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  29.31 
 
 		 221 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 108 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 99 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 201 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 124 aa  41.2  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 99 aa  41.2  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  35.8 
 
 		 348 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  30.56 
 
 		 352 aa  40.4  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 69 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 79 aa  40.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 335 aa  40.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>