43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0037 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  312  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 161 aa  216  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 160 aa  201  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  63.41 
 
 		 161 aa  200  7e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  45.51 
 
 		 182 aa  139  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  37.11 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 134 aa  93.6  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  33.52 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  28.12 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  31.74 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 183 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2081  DNA binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2878  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 235 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0029  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 85 aa  44.3  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3353  XRE family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2926  Fis family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678483  normal  0.125952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3781  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 279 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2656  transcription factor of MBF1-like protein  32.1 
 
 		 186 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 513 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 371 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>