More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5000 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 228 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  80.18 
 
 		 228 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  62.5 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  62.5 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  62.07 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  59.91 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  60.34 
 
 		 240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  59.91 
 
 		 239 aa  244  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  64.45 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  64.45 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  64.45 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  60.68 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  60.35 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  60.34 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  58.59 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  60.78 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  60.81 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  59.19 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  63.51 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  61.03 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  59.62 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  61.5 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  58.93 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  58.85 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  54.11 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  61.58 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  56.83 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  59.91 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  55.6 
 
 		 239 aa  218  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  57.64 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  59.07 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.24 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.75 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 273 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  35.87 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.6 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.53 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  32.51 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.28 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.94 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.49 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  36.79 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.19 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  35.11 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  30 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  31.28 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0454  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 298 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.39 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.52 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  26.48 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>