212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4892 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  38.91 
 
 		 1008 aa  678    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  39.38 
 
 		 1065 aa  782    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  46.37 
 
 		 1117 aa  963    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  40.21 
 
 		 1069 aa  671    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  40.98 
 
 		 1016 aa  728    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  100 
 
 		 1089 aa  2208    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  55.37 
 
 		 1059 aa  1123    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  46.51 
 
 		 1104 aa  966    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  36.69 
 
 		 1051 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  35.49 
 
 		 1183 aa  582  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  35.52 
 
 		 1147 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  36.93 
 
 		 1107 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  33.64 
 
 		 1186 aa  544  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  30.46 
 
 		 1167 aa  446  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  30.32 
 
 		 1094 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  30.2 
 
 		 1094 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  30.41 
 
 		 1093 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  30.23 
 
 		 1093 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  30.11 
 
 		 1094 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  29.72 
 
 		 1354 aa  439  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  30.11 
 
 		 1094 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  30.23 
 
 		 1093 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  29.09 
 
 		 1075 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  38.24 
 
 		 1181 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  29.23 
 
 		 1094 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  29.66 
 
 		 1094 aa  426  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  31.32 
 
 		 1084 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  29.35 
 
 		 1079 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  30.05 
 
 		 1104 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  29.46 
 
 		 1094 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  28.57 
 
 		 1092 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  29.27 
 
 		 1094 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  29.15 
 
 		 1097 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  28.95 
 
 		 1090 aa  300  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  27.07 
 
 		 1067 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  27.55 
 
 		 1082 aa  264  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  24.33 
 
 		 1097 aa  217  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  29 
 
 		 1545 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  28.6 
 
 		 1545 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.31 
 
 		 1084 aa  174  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  29.89 
 
 		 1193 aa  157  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  32.52 
 
 		 1125 aa  142  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  27.9 
 
 		 428 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.9 
 
 		 425 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  29.84 
 
 		 1484 aa  109  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  27.01 
 
 		 427 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.98 
 
 		 1076 aa  95.1  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.05 
 
 		 465 aa  90.1  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  26.75 
 
 		 482 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.45 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.04 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  25.56 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.52 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  29.27 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  27.36 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.62 
 
 		 444 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.36 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.07 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  31.93 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  29.23 
 
 		 1059 aa  62.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  22.64 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  22.63 
 
 		 1067 aa  62  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.26 
 
 		 1071 aa  61.6  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  31.3 
 
 		 1062 aa  60.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.79 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  21.81 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  35.63 
 
 		 1138 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.67 
 
 		 670 aa  58.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  31.03 
 
 		 1078 aa  58.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  22 
 
 		 1081 aa  58.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  25.56 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  22.79 
 
 		 428 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  21.45 
 
 		 410 aa  57.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  23.99 
 
 		 379 aa  57.4  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.17 
 
 		 453 aa  58.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.8 
 
 		 1066 aa  57.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  38 
 
 		 472 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  26.74 
 
 		 449 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.03 
 
 		 434 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  22.4 
 
 		 1062 aa  57.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 429 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  24.4 
 
 		 429 aa  56.2  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.11 
 
 		 434 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 445 aa  56.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  23.44 
 
 		 428 aa  56.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  22.72 
 
 		 445 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.03 
 
 		 434 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  28.81 
 
 		 444 aa  55.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  21.93 
 
 		 1062 aa  55.5  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  21.93 
 
 		 1062 aa  55.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  30.15 
 
 		 437 aa  55.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 444 aa  55.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.21 
 
 		 440 aa  54.7  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  30.68 
 
 		 1069 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  21.17 
 
 		 429 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  25.97 
 
 		 445 aa  54.3  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  31.37 
 
 		 441 aa  54.3  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.57 
 
 		 438 aa  54.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 383 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1084 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>