More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0505 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  100 
 
 		 363 aa  714    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  38.86 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 391 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 371 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 372 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 377 aa  189  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  37.57 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 417 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 426 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 462 aa  175  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.24 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  34.83 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  33.75 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  32.98 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  31.47 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 454 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  33.73 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.87 
 
 		 427 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  29.83 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 356 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.19 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  34.51 
 
 		 388 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  31.61 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  37.23 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.15 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  33.72 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  33.52 
 
 		 373 aa  156  7e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 403 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  29.15 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  33.14 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.77 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  27.04 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3888  sugar ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1411  sugar ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222594  normal  0.0344411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  32.97 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2441  inner-membrane translocator  32.08 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0141444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0698  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 377 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  33.42 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  31.06 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2115  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  31.55 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  32.56 
 
 		 371 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0826  inner-membrane translocator  34.17 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  29.53 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0678  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 380 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.606458  normal  0.506985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  32.64 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 528 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  28.03 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2945  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3824  sugar ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3531  ABC transporter, permease  31.88 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3549  ABC transporter permease  31.88 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  31.34 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  31.37 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3802  sugar ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000174596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3837  sugar ABC transporter, permease protein  32.15 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.05 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  34.54 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 364 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  28.42 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  28.37 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0917  inner-membrane translocator  30.81 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1314  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.725707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.42 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>