86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2155 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2155  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 		 351 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0989166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2186  hypothetical protein  49.16 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3221  hypothetical protein  47.7 
 
 		 341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2575  hypothetical protein  47.67 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2032  class II aldolase/adducin family protein  39.84 
 
 		 384 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.635701  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1997  class II aldolase/adducin family protein  35.48 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14011  hypothetical protein  34.3 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1395  class II aldolase/adducin-like  37.93 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0324487 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 		 705 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 680 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0696  class II aldolase/adducin family protein  23.98 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2749  class II aldolase/adducin family protein  26.38 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 705 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  32.05 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 705 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 706 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 		 653 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 684 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  29.57 
 
 		 689 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 		 705 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.85 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.34 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  29.35 
 
 		 705 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 		 694 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 		 696 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 677 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 		 683 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  29.38 
 
 		 701 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 		 701 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 707 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 		 698 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 		 678 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  27.92 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  27.92 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 691 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  28.37 
 
 		 706 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  25.56 
 
 		 707 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 689 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 571 aa  62.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.63 
 
 		 695 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 		 684 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  30.5 
 
 		 664 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 680 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  23.72 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  28.64 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 679 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 690 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 		 680 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4067  class II aldolase/adducin family protein  30.89 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  25.57 
 
 		 713 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 		 652 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 		 682 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  30.1 
 
 		 729 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  28.35 
 
 		 700 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 729 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  26.42 
 
 		 730 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 688 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 688 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  28.89 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1605  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.35 
 
 		 241 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  25.85 
 
 		 699 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3319  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 		 253 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  27.18 
 
 		 707 aa  49.3  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  26.13 
 
 		 705 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 		 730 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  26.2 
 
 		 698 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  24.67 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  26.74 
 
 		 698 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  25 
 
 		 214 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  26.09 
 
 		 702 aa  44.3  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  26.23 
 
 		 222 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4066  class II aldolase/adducin family protein  29.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  30.46 
 
 		 220 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  25.95 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>