More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0739 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  53.38 
 
 		 942 aa  990    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 912 aa  1876    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  38.55 
 
 		 908 aa  592  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03827  TonB-dependent receptor  37.53 
 
 		 892 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37900  putative TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 846 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00691809  normal  0.333573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  36.56 
 
 		 973 aa  502  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2871  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 935 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1769  TonB-dependent receptor  35.33 
 
 		 985 aa  457  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 925 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1100  outer membrane receptor protein  28.26 
 
 		 922 aa  318  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000948721  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 869 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 861 aa  259  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 861 aa  258  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 861 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 861 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 861 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 861 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2904  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 944 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 871 aa  240  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03700  TonB-dependent outer membrane receptor  33.75 
 
 		 532 aa  240  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 843 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 874 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 857 aa  233  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 838 aa  227  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 841 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 951 aa  221  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 869 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 941 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 867 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 941 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 941 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 867 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 867 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 876 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 867 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 982 aa  208  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  25.74 
 
 		 834 aa  197  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 981 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 903 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 965 aa  195  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 868 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 1000 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 948 aa  191  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 967 aa  190  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 938 aa  190  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 893 aa  188  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.91 
 
 		 914 aa  187  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 901 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03701  TonB-dependent outer membrane receptor  45.78 
 
 		 311 aa  181  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00553  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 1028 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  45.77 
 
 		 866 aa  177  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 950 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  40.53 
 
 		 895 aa  172  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 924 aa  171  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 935 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  39.13 
 
 		 899 aa  167  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 890 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 890 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  40.35 
 
 		 890 aa  166  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 922 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1132  TonB-dependent receptor plug  24.33 
 
 		 930 aa  160  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.746055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 914 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 981 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 896 aa  158  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  43.4 
 
 		 842 aa  157  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  39.71 
 
 		 893 aa  157  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  45 
 
 		 827 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 1009 aa  155  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  41.44 
 
 		 853 aa  151  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  41.44 
 
 		 855 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  41.44 
 
 		 853 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  41.44 
 
 		 853 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  41.44 
 
 		 853 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0341  TonB-dependent receptor  40.09 
 
 		 909 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000307773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  41.44 
 
 		 853 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 836 aa  147  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  41.54 
 
 		 875 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 855 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 883 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 883 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0516  TonB-dependent receptor  38.22 
 
 		 909 aa  145  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0428705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  41.3 
 
 		 849 aa  145  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 883 aa  144  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  40.99 
 
 		 855 aa  144  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 852 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2693  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 1006 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 924 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  40 
 
 		 709 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 924 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 924 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  42.73 
 
 		 929 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  38.86 
 
 		 987 aa  140  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  37.16 
 
 		 904 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 953 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 937 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  37.77 
 
 		 891 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 873 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  37.38 
 
 		 869 aa  138  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 974 aa  138  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 904 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>