194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6960 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 392 aa  786    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  65.01 
 
 		 388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  43.7 
 
 		 394 aa  324  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  47.81 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  46.06 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  46.92 
 
 		 390 aa  305  9.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  43.7 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  47.03 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  42.42 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  45.95 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  46.76 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  40.52 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  41.18 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  42.97 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  41.53 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  41.76 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  43.89 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  42.01 
 
 		 389 aa  255  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  40.98 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  40.68 
 
 		 441 aa  229  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  41.61 
 
 		 350 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  32.33 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  32.35 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  35.84 
 
 		 380 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  32.88 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  35.88 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  32.65 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  30.25 
 
 		 421 aa  155  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  35.35 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  33.53 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  30.73 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  32.13 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  28.22 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.88 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  30.26 
 
 		 385 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  31.13 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  30.87 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  30.19 
 
 		 436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  30 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  30.67 
 
 		 415 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  27.67 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  30 
 
 		 411 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.86 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  31.99 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  32.62 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.67 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  30.73 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  30.67 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  31.38 
 
 		 339 aa  144  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  32.76 
 
 		 407 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  28.75 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  29.13 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  30.03 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  30.05 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  30.69 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  32.01 
 
 		 409 aa  137  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  28.03 
 
 		 425 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  30.81 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  27.87 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  31.14 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  29.71 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  28.29 
 
 		 393 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  27.25 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  29.35 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  27.66 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  50.36 
 
 		 139 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.23 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  28.73 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  26.93 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  29 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  28.53 
 
 		 427 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  28.53 
 
 		 427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  29.19 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  29.19 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  29.3 
 
 		 413 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.9 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.98 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  28.66 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  24.72 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  29.36 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  26.63 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  28.22 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  26.3 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  27.33 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  25.36 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  29.75 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  26.76 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  26.56 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  27.03 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  34.46 
 
 		 259 aa  90.9  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2000  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.88 
 
 		 476 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670199  normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  27.05 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2828  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.87 
 
 		 485 aa  86.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.925455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1973  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  26.89 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  29.17 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  29.13 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  25.3 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  25.27 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  26.3 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  27.46 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>