152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2743 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 847 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 847 aa  1724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  31.62 
 
 		 515 aa  119  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  34.55 
 
 		 231 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  24.07 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  23.72 
 
 		 582 aa  107  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  32.02 
 
 		 239 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  29.76 
 
 		 239 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0783  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 601 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  31.36 
 
 		 452 aa  89.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  34.64 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0055  hypothetical protein  25.86 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  42.86 
 
 		 244 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  28.89 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  26.84 
 
 		 232 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  28.33 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  49.15 
 
 		 85 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 		 77 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 95 aa  62.4  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 164 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 92 aa  60.8  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 		 76 aa  60.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  43.75 
 
 		 82 aa  60.8  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  26.13 
 
 		 251 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  24.21 
 
 		 250 aa  60.1  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  23.84 
 
 		 248 aa  60.1  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  24.04 
 
 		 244 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  28.32 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  43.75 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  32.41 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  37.93 
 
 		 61 aa  57  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  37.93 
 
 		 61 aa  57  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  57  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 71 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  26.19 
 
 		 264 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  34.43 
 
 		 81 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  36.84 
 
 		 79 aa  56.6  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  57  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  26.09 
 
 		 240 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  21.9 
 
 		 231 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 127 aa  55.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  30.77 
 
 		 143 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 194 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 184 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 174 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 		 97 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 61 aa  55.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  21.9 
 
 		 233 aa  55.5  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  38.16 
 
 		 86 aa  55.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 68 aa  55.1  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  40 
 
 		 70 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 		 119 aa  53.9  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  34.62 
 
 		 128 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  34.62 
 
 		 128 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  34.62 
 
 		 128 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  41.07 
 
 		 148 aa  53.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  23.84 
 
 		 231 aa  52.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  33.33 
 
 		 128 aa  52.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 108 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  32.76 
 
 		 61 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  38.98 
 
 		 61 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  27 
 
 		 138 aa  52.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  41.33 
 
 		 170 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  34.67 
 
 		 98 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 61 aa  51.6  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 		 68 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 110 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 110 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  38.6 
 
 		 110 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 84 aa  51.2  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 66 aa  51.2  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 65 aa  50.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  33.73 
 
 		 131 aa  50.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  37.1 
 
 		 127 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  35.38 
 
 		 178 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 161 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  39.13 
 
 		 82 aa  50.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  41.07 
 
 		 129 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 62 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  44.23 
 
 		 547 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  50.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 67 aa  50.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 128 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.94 
 
 		 418 aa  49.3  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  42.19 
 
 		 150 aa  49.3  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 256 aa  49.3  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 481 aa  48.9  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  45.83 
 
 		 59 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 394 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  31.11 
 
 		 190 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>