39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1592 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  437  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  97.4 
 
 
231 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  88.1 
 
 
231 aa  361  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  29.96 
 
 
240 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  31.82 
 
 
244 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  32.71 
 
 
239 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  30.91 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  31.49 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  29.18 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  28.76 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  28.7 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  28.5 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  28.91 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  29.81 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  28.3 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  28.91 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  27.24 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  28.89 
 
 
847 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  35.76 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  28.57 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  24.15 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  25.26 
 
 
244 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  22.03 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  36.03 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  29.76 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  31.05 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  22.58 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  34.67 
 
 
334 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  23.44 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  34.38 
 
 
280 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  21.3 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  27.51 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  30.28 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  30.28 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  30.28 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  30.28 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  20.87 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>