39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0419 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  600  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  42.31 
 
 
285 aa  229  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  34.82 
 
 
244 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  30.18 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  30.54 
 
 
240 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  30.77 
 
 
235 aa  96.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  29.2 
 
 
244 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  31.82 
 
 
250 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  30.95 
 
 
231 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  29.72 
 
 
231 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  28.52 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  24.16 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  28.77 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  31.05 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  30.5 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  29.5 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  23.88 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  37.01 
 
 
334 aa  63.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  26.64 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  26.64 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  26.64 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  26.64 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  28.07 
 
 
244 aa  62.4  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  32.14 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  27.11 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  31.79 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  23.99 
 
 
308 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  26.44 
 
 
235 aa  56.6  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  35.56 
 
 
280 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  30.32 
 
 
261 aa  52.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  23.33 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  21.05 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  21.05 
 
 
228 aa  49.3  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  21.9 
 
 
275 aa  49.3  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.48 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  21.34 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  23.77 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  21.19 
 
 
240 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  24.45 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>