31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4307 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  35.24 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  32.27 
 
 		 308 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  28.49 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  28.88 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  37.74 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  38.61 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  32.37 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  38.32 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  29.89 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  30.83 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  26.63 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  36.63 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  35.24 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  34.56 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  29.76 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  26.44 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  31.73 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  31.68 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  30.88 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  24.68 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  24.29 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  29.05 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  31.19 
 
 		 285 aa  46.2  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.86 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  27.64 
 
 		 847 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  27.59 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>