30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0421 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  570  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  42.31 
 
 
301 aa  225  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  32.5 
 
 
250 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  30.62 
 
 
231 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  30.17 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  27.76 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  29.11 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  28.64 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  24.41 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  26.59 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  26.44 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  25.74 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  27.03 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  25.42 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  32.2 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  29.59 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  20.69 
 
 
239 aa  60.1  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  24.45 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  23.08 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  26 
 
 
243 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  36.14 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  30.37 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  27.08 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  30.61 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  19.15 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  20.43 
 
 
246 aa  42.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>