45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3568 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  37.84 
 
 
239 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  34.27 
 
 
244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  33.47 
 
 
250 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  32.71 
 
 
244 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  32.08 
 
 
239 aa  115  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  33.18 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  32.09 
 
 
248 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  31.48 
 
 
231 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  31.9 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  30.99 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  29.96 
 
 
301 aa  92.4  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  28.51 
 
 
228 aa  89  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  28.51 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  27.76 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  29.06 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  30.32 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  29.82 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  24.48 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  30.23 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  24.37 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  22.98 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  34.91 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  34.91 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  34.91 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  34.91 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  24.7 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  32.37 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  22.42 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  24.31 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  24.14 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  27.13 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  27.84 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  23.18 
 
 
308 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  25.24 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  21.88 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  28.26 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  24.86 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  18.35 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  19.23 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  36.25 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  18.59 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  23.31 
 
 
847 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>