39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1829 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  33.81 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  35.41 
 
 		 261 aa  85.1  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  30.9 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  29.52 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  29.38 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  30.48 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  27.14 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  34.33 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  24.68 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  33.66 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  25.11 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  26.96 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  26.48 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  27.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  29.86 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  29.86 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  29.86 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  29.86 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  26.39 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03655  hypothetical protein  21.17 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  27.05 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  23.72 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  24.68 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  26.13 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  34.13 
 
 		 308 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  25.12 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  30.37 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  33.93 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  22.59 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  24.86 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  24.86 
 
 		 847 aa  45.4  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  22.49 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  24.06 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  24.77 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>