34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0125 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  35.41 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  30.19 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  32.94 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  30 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  34.56 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  28.88 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  37.09 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  35.76 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  35.76 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  27.78 
 
 
216 aa  62.4  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  30.66 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  29.59 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  28.28 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  37.62 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  27.13 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  26.29 
 
 
244 aa  52.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  30.32 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  31.21 
 
 
240 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  30.53 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  28.93 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  32.64 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0151  hypothetical protein  22.89 
 
 
250 aa  45.4  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.07608e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  24.86 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2058  hypothetical protein  22.89 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000064405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  27.34 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  31.62 
 
 
334 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.53 
 
 
239 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>