15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0202 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  31.62 
 
 
270 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  28.49 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  25.6 
 
 
308 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  26.6 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  25.86 
 
 
243 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  25.86 
 
 
243 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  25.86 
 
 
243 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  25.86 
 
 
243 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  24.86 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  24.06 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  22.73 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  22.45 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  27.94 
 
 
248 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  23.49 
 
 
214 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>