51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2749 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  464  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  45.87 
 
 
244 aa  198  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  34.44 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  34.32 
 
 
251 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  32.88 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  32.64 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  30.28 
 
 
231 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  29.49 
 
 
231 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  33.03 
 
 
216 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  26.89 
 
 
239 aa  104  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  27.08 
 
 
228 aa  102  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  29.03 
 
 
231 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  27.08 
 
 
228 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  29.88 
 
 
250 aa  96.3  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  30.91 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  29.29 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  30.2 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  25.11 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  30.9 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  27.45 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  27.76 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  27.14 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  24.58 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  26.42 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  24.55 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  29.13 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  26.63 
 
 
235 aa  62  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  23.08 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  21.89 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  26.99 
 
 
270 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  26.09 
 
 
847 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  22.61 
 
 
214 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  23.38 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  31.21 
 
 
261 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4363  hypothetical protein  23.53 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0373476  normal  0.295669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0151  hypothetical protein  21.15 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.07608e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2058  hypothetical protein  21.15 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000064405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06035  lipoprotein, putative  23.51 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  20.18 
 
 
294 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  31.78 
 
 
308 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03655  hypothetical protein  22.71 
 
 
246 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  20.43 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06025  lipoprotein, putative  19.81 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  22.45 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  20.72 
 
 
264 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>