47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0902 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  86.8 
 
 
248 aa  427  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  32.34 
 
 
244 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  33.18 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  29.15 
 
 
264 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  28.51 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  33.48 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  31.98 
 
 
216 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  28.82 
 
 
294 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  28.63 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  29.88 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  30.49 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  29.05 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  31.75 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  31.33 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  28.7 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  28.64 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  30.19 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  27 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  24.43 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  25.94 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  27.1 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  25.74 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  32.06 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  32.06 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  32.06 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  32.06 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  29.38 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  24.29 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  38.61 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  23.74 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  22.35 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  24.68 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  23.74 
 
 
228 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  24.21 
 
 
847 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  28.22 
 
 
243 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  25 
 
 
847 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  19.92 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  20.69 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  25.56 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  26.6 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  26.09 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  21.16 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  28.16 
 
 
334 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  21.61 
 
 
244 aa  45.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  20.87 
 
 
233 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>