39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1934 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  31.95 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  31.49 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  30.17 
 
 		 244 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  28.38 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  32.56 
 
 		 244 aa  92  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  31.62 
 
 		 248 aa  91.7  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  29.74 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  26.98 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  28.15 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  29.17 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  29.69 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  29.38 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  29.38 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  27.27 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  30.5 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  27.05 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  28.91 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  28.85 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  29.71 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  29.89 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  27.02 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  33.85 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  33.85 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  33.85 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  33.85 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  26.47 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  24.78 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  27.81 
 
 		 847 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  22.55 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  24.43 
 
 		 308 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  22.05 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  21.81 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  24.41 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  22.32 
 
 		 264 aa  45.1  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  22.58 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  21.79 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06035  lipoprotein, putative  25.66 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>