20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2843 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  25.82 
 
 
228 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  25.82 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  22.42 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  23 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  22.61 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  25.23 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  23.6 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  24.31 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  21.78 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  21.08 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  25.12 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  22.03 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  27.59 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  23.49 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  24.41 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>