42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0745 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  495  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  35.37 
 
 
244 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  37.71 
 
 
239 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  34.27 
 
 
244 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  33.47 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  32.64 
 
 
240 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  32.03 
 
 
228 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  32.03 
 
 
228 aa  95.5  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  32.5 
 
 
285 aa  94  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  28.7 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  26.05 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  31.75 
 
 
250 aa  88.6  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  32.92 
 
 
301 aa  87.8  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  25.54 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  30.77 
 
 
248 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  27.6 
 
 
216 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  29.58 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  28.3 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  27.36 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  27.36 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  26.89 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  25.89 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  37.74 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  27.36 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  31.43 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  26.45 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  27.23 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  26.49 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  30.48 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  22.75 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  20.59 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  23.27 
 
 
251 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  30.93 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  22.03 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  27.34 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  31.88 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  32.28 
 
 
280 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  20.52 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>