22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0855 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  594  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  32.27 
 
 		 235 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  29.92 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  27.03 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  32.76 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  32.76 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  32.76 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  32.76 
 
 		 243 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  25.6 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  23.99 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  29.01 
 
 		 235 aa  52.4  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  24.31 
 
 		 214 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  24.43 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  34.13 
 
 		 248 aa  49.3  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  31.82 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  28.44 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  32.64 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  31.78 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  32.32 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  27.2 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  31.01 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>