50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11208 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  45.87 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  33.9 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  34.27 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  34.27 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  36.65 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  30.3 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  32.64 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  33.8 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  33.8 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  28.63 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  31.16 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  28.15 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  32.56 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  27.98 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  28.86 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  27.2 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  26.67 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  27.2 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  27.35 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  30.17 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  25.1 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  28.44 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  28.44 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  28.44 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  28.44 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  24.29 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  29.52 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  24.64 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  22.61 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  22.08 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2058  hypothetical protein  23.45 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000064405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0151  hypothetical protein  23.45 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.07608e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  29.69 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  37.86 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  31.68 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  25.23 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  26.29 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  23.63 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  20.63 
 
 		 847 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  29.2 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  20.81 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  31.82 
 
 		 308 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  24.9 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  18.58 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  20.47 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  20.81 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  24.44 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>