21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0014 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  89.61 
 
 		 231 aa  417  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  84.85 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  24.78 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  25.65 
 
 		 264 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  26.09 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  27.15 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  25.22 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  26.47 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  23.84 
 
 		 847 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  23.83 
 
 		 847 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  20.18 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  20.69 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  22.32 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  20.87 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  26.14 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  20.47 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  20.43 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  19.63 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  20.85 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>