38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4258 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  35.78 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  34.3 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  34.55 
 
 		 847 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  32.81 
 
 		 847 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  30.97 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  26.48 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  31.51 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  25.91 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  27.27 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  31.88 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  24.43 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  28.91 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  28 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  26.45 
 
 		 237 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  24.64 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  22.41 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  34.38 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  24.7 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  24.89 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  24.15 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  24 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  23.67 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  23.01 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  21.89 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  22.16 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  23.65 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  22.18 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  24.75 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  21.84 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  19.23 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  20.59 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0151  hypothetical protein  21.36 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.07608e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2058  hypothetical protein  21.36 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000064405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  23.89 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  19.47 
 
 		 301 aa  42.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  27.52 
 
 		 244 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>