20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1410 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  431  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  27.35 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  29.41 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  25.89 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  26.02 
 
 
239 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  27.62 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  23.59 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  26.74 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  26.74 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2843  hypothetical protein  23.44 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  24.59 
 
 
847 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  26.34 
 
 
232 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  25.13 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  28.16 
 
 
847 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  26.09 
 
 
250 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  31.03 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  19.63 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  22.69 
 
 
273 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  25.43 
 
 
233 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>