30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3536 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  454  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  35.02 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  33.81 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  30.23 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  30.2 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  26.67 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  29.06 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  23.73 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  24.29 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  23.58 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  24.88 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  23.12 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  22.54 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  28.32 
 
 		 847 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  32.14 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  22.9 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  31.05 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  30.24 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  21.57 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  22.66 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  24.17 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  27.08 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  23.47 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1410  hypothetical protein  30.51 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478067  hitchhiker  0.0000133101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>