34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4509 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0202  hypothetical protein  31.62 
 
 
228 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.786759  normal  0.482962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4307  hypothetical protein  35.24 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0855  hypothetical protein  29.92 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  34.96 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  34.17 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  34.17 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  34.17 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  34.17 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  30.66 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  36.57 
 
 
231 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  26.99 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  35.29 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  32.88 
 
 
301 aa  57  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  30.28 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  27.01 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  27.01 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  32.84 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  30.48 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  29.2 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  25.56 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  24.17 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  30.47 
 
 
251 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  28.26 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.94 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  36.14 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  27.78 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  26.6 
 
 
244 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  31.78 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  34.26 
 
 
280 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  32.38 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  27.64 
 
 
236 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  22.41 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  24.77 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>