37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2974 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2974  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  480  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11208  hypothetical protein  27.88 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0737166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3536  hypothetical protein  30.2 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.189372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0745  hypothetical protein  29.58 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.664891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  29.33 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  30.1 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  29.13 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1934  hypothetical protein  29.05 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1200  hypothetical protein  27.88 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6853  hypothetical protein  29.17 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730342 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0068  conserved hypothetical protein, secreted  25.93 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.714566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2749  hypothetical protein  27.45 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3568  hypothetical protein  24.37 
 
 
235 aa  72  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.781941  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  25.51 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1151  hypothetical protein  23.11 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1673  hypothetical protein  24.79 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  27.02 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0507  putative lipoprotein  24.37 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1903  hypothetical protein  24.35 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124132  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  24.57 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0902  hypothetical protein  28.22 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000720917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1828  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0106311  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4339  hypothetical protein  23.01 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.595602  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4449  hypothetical protein  23.01 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00437354  normal  0.155961 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5044  hypothetical protein  23.01 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1737  hypothetical protein  23.01 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.420885 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1829  hypothetical protein  26.13 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00114945  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_002950  PG0421  hypothetical protein  26 
 
 
285 aa  52  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.543904 
 
 
-
 
NC_002950  PG0419  hypothetical protein  23.33 
 
 
301 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0125  hypothetical protein  30.53 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1016  hypothetical protein  30.43 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.931017  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  28.08 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4509  hypothetical protein  31.78 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  22.41 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  23.88 
 
 
239 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  23.89 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_002950  PG1005  putative lipoprotein  22.46 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.850522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>